《表1 sgRNA序列:利用CRISPR/Cas9技术敲除长非编码RNA SNHG16基因促进K562细胞CD235a的表达上调》

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《利用CRISPR/Cas9技术敲除长非编码RNA SNHG16基因促进K562细胞CD235a的表达上调》


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使用sgRNA设计网站http://crispr.mit.edu,分别针对SNHG16 5′端和3′端设计sg RNA,由于SNHG16Exon4的3′端与其他基因存在重合,因此只能在Exon4上与该基因不重合的部分设计3′端sg RNA。输入目的序列后,根据结果在基因5′端和3′端各挑选两个评分在75分以上的sg RNA,命名为5′-sg1、5′-sg2、3′-sg1、3′-sg2,由于载体使用限制性内切酶Bsmb I进行酶切,需要在sg RNA的5′端添加CACC,在互补链的5′端添加AAAC,最终获得的sg RNA序列如下,见表1。