《表1 干扰靶位点序列:靶向人巨细胞病毒UL145基因的CRISPR/Cas9基因敲除质粒的构建》

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《靶向人巨细胞病毒UL145基因的CRISPR/Cas9基因敲除质粒的构建》


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HCMV临床低传代D3病毒株UL145完整的基因序列来自GenBank数据库,序列号为DQ180367.1;设计gRNA及含PAM序列的DNA片段,以HCMV临床低传代D3病毒株UL145基因为目的基因,根据CRISPR/Cas9设计的原则,利用CRISPR在线设计工具(https://crispr.dbcls.jp/)寻找打靶序列,具体过程如下:从UL145基因外显子上寻找富含NGG并位于同一外显子上的序列,并提交至CRISPR在线工具;根据在线工具的结果,确定潜在的3条gRNA序列,分别命名为T1、T2、T3,见表1。