《表2 FY2的特异性PCR引物》

《表2 FY2的特异性PCR引物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《汾远2号远志的rDNA ITS等位基因特异性PCR鉴别研究》


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测序所得序列,用生物学软件DNAStar version 4.0校对拼接,去除低质量序列及引物区。测序所得的序列采用NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)网站在线BLAST程序进行序列同源性检索,结果表明JY1、FY2与NCBI中远志的相似度最高(相似度达99.36%),证实测序结果具有很好的可靠性。利用DNAMAN对比上述所有样品的序列,找出FY2所不同于其他远志序列的差异位点,并用FY2的序列和NCBI中已有的远志序列(NCBI登录号分别为:KM051449.1、AB507258.1、DQ267099.1)和作者测序得到的卵叶远志的序列(NCBI登记号为:1885126)进行比对,验证差异位点的正确性。FY2和JY1、卵叶远志以及NCBI网上远志序列的比对结果见图1。FY2在第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C,共有两个差异位点。根据FY2差异位点的位置,利用生物学软件Primer premier 5.0分别在ITS序列的上、下游各设计约20个碱基的引物[14-15],最终确定FY2的4对特异性PCR引物,见表2。