《表1 团头鲂mc3r基因克隆及荧光定量PCR所用引物》
根据团头鲂转录组中已获得的mc3r基因序列片段,设计引物(表1)结合RACE试剂盒(Invitrogen)和SMARTerTM RACE cDNA AmplificationKit试剂盒(Clontech)扩增5′端和3′端序列。RACE-PCR产物经电泳后对目的条带进行切胶回收纯化,与pMD18T进行连接,转化后对阳性克隆进行测序,最后通过拼接获得完整的cDNA序列。应用DNAMAN 6.0对团头鲂MC3R氨基酸序列进行分析比对。其磷酸化位点通过Netphos 3.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos-3.1/)和NetNG Lyc 1.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/)进行预测。团头鲂MC3R结构域通过疏水性检测(http://web.expasy.org/cgi-bin/protscale/protscale.pl)、跨膜结构域预测(TMHMM Server V.2.0,http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM2.0/)进行分析。采用MEGA6.0软件中的Neighbor Joining方法构建团头鲂MC3R序列系统发育树1000次自举(Bootstrap)检验计算各节点支持率。
图表编号 | XD0063701800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.01 |
作者 | 廖盛臣、陈凯、习丙文、秦婷、潘良坤、谢骏 |
绘制单位 | 南京农业大学无锡渔业学院、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室、南京农业大学无锡渔业学院、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室、南京农业大学无锡渔业学院、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村 |
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