《表1 团头鲂mc3r基因克隆及荧光定量PCR所用引物》

《表1 团头鲂mc3r基因克隆及荧光定量PCR所用引物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《团头鲂黑素皮质素3型受体基因克隆及表达分析》


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根据团头鲂转录组中已获得的mc3r基因序列片段,设计引物(表1)结合RACE试剂盒(Invitrogen)和SMARTerTM RACE cDNA AmplificationKit试剂盒(Clontech)扩增5′端和3′端序列。RACE-PCR产物经电泳后对目的条带进行切胶回收纯化,与pMD18T进行连接,转化后对阳性克隆进行测序,最后通过拼接获得完整的cDNA序列。应用DNAMAN 6.0对团头鲂MC3R氨基酸序列进行分析比对。其磷酸化位点通过Netphos 3.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos-3.1/)和NetNG Lyc 1.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/)进行预测。团头鲂MC3R结构域通过疏水性检测(http://web.expasy.org/cgi-bin/protscale/protscale.pl)、跨膜结构域预测(TMHMM Server V.2.0,http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM2.0/)进行分析。采用MEGA6.0软件中的Neighbor Joining方法构建团头鲂MC3R序列系统发育树1000次自举(Bootstrap)检验计算各节点支持率。