《表1 各内参基因荧光引物扩增信息》

《表1 各内参基因荧光引物扩增信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《龟裂链霉菌M527荧光定量PCR内参基因的选择及其稳定性评估》


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从NCBI网站下载各内参基因序列信息,在龟裂链霉菌M527基因组中比对得到相应的内参基因序列,命名为16S rRNAsr、hrdBsr、rpoAsr、sigFsr、sigBsr、gyrBsr。根据比对到的内参基因序列,使用Primer Premier 6.0设计荧光引物,如表1。引物需制作标准曲线验证引物的特异性以及扩增效率,使用cDNA为模板,以1:5的比例将模板稀释成5个梯度进行试验。采用TB Green?Premix Ex TaqTM II(TliRNaseH Plus)试剂盒进行RT-qPCR试验,每个样品3次重复,反应体系为20μL:TB Green Premix Ex Taq II(TliRNaseH Plus)(2×)10μL,PCR Forward Primer(10μM)0.8μL,PCR Reverse Primer(10μmol/L)0.8μL,ROX Reference Dye II(50×)0.4μL,c DNA模板2μL,灭菌水6μL;反应条件为:94℃30 s;94℃5 s,60℃31 s,40个循环;95℃15 s,60℃60 s,95℃15 s。试验使用Applied Biosystems StepOnePlus Real-Time PCR System(Life Technologies)仪器。要求所设计引物的熔解曲线峰型单一、所作标准曲线R2>0.98、扩增效率(Efficiency)90%~110%,方可用于后续试验。