《表1 构建sgRNA表达载体引物、基因组扩增引物及荧光定量PCR引物信息》

《表1 构建sgRNA表达载体引物、基因组扩增引物及荧光定量PCR引物信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《CRISPR/Cas9系统介导的miR-155基因敲除细胞的制备》


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利用sgRNAcas9软件在ssc-miR-155前体区域设计4条特异性的sgRNA引物,引物名称分别为sgRNA39F/R、sgRNA42F/R、sgRNA51F/R、sgRNA52F/R(表1),以pGL3-U6-sgRNA-PGK-puromycin(Addgene:#51133,简写pGL3-U6-sgRNA)载体为骨架构建表达载体。提取包含4条sgRNA靶位点及ssc-miR-155前体序列在内的696 bp基因组序列,用Premier5.0软件设计最佳的PCR扩增引物对ssc-miR-155F/R(表1),引物合成由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。sgRNA表达载体构建步骤为:取浓度为10μmol/L的前向与反向引物各5μL在PCR仪上用95℃,10 min;65℃,1 h;pGL3-U6-gRNA质粒用Bsa I酶(NEB北京)进行酶切,酶切回收备用,连接退火后的sgRNA;将退火后的sgRNA稀释100倍,取1μL与酶切的pGL3-U6-gRNA质粒,使用T4DNA连接酶(宝生物工程(大连)有限公司)16℃连接1 h;取2μL连接产物,转化到DH5α感受态细胞(宝生物工程(大连)有限公司)中,涂布到加了氨苄的LB固体培养基上,挑选用PCR扩增(此时用U6左引物和sgRNA右引物鉴定阳性克隆)鉴定成功的单克隆菌液,送生工生物工程(上海)股份有限公司用“U6seqF”引物测序鉴定,将靶向ssc-miR-155前体的不同位置sgRNA表达载体分别命名为:sgRNA51、sgRNA52、sgRNA42和sgRNA39。测序正确的阳性菌扩大培养,用无内毒素质粒提取试剂盒(Endo-free Plasmid DNA Mini KitⅡ,Omega Bio-Tek)抽提表达质粒,测定浓度后备用。