《表4 28份地黄材料在8个SNP位点的碱基信息》

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《基于地黄转录组数据的SNP标记开发与地黄指纹图谱构建》


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为开发多态性地黄SNP引物,我们用2.2实验筛选出的28对特异性引物对28种地黄种质进行分型实验(图2)。经过PCR扩增目的片段,切胶纯化回收后用Sanger法直接测序。在28对引物扩增的PCR产物中,能够直接测序成功并且SNP位点在不同地黄种质间不同的仅有7对(表3)。经过DNAMAN序列比对软件比对后,可以直观的看出不同地黄种质间的SNP位点变化,位点SNP1的比对图如图2所示。经测序后统计7对引物所包含的8个SNP位点在28种地黄种质间的检测结果,如表4所示。