《表1 基因扩增及实时荧光定量PCR引物》

《表1 基因扩增及实时荧光定量PCR引物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《紫苜蓿盐诱导NAC转录因子的鉴定、克隆及表达分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

植物中转录因子对盐胁迫的响应通常包含两类:一类为早期响应(一般在胁迫0.5~3 h内响应表达),另一类为中晚期响应(通常在胁迫处理6~24 h时诱导或抑制表达),因此,早期盐胁迫处理我们选取1 h时间点取材,中晚期盐胁迫处理选择24 h时间点取材(选取该时间点亦是为了避免光周期对基因表达的影响)。转录组测序由北京诺和生物技术公司完成。转录因子筛选参考Zheng等(2016)和董蔚等(2018)。简要描述为:对照(0 h)及盐胁迫处理1、24 h样品的测序片段经拼接、组装后,利用hmmscan软件对测序片段进行预测分析,然后利用加权截尾均值(trimmed mean of M-values,TMM)法对测序数据进行标准化处理,筛选差异表达基因[筛选标准为q≤0.005且|log2(变化倍数)|≥1]。获得差异表达基因后,将它们与蒺藜苜蓿(M.truncatrula)基因组数据库进行序列比对分析,获得其最为同源的基因,然后根据同源基因设计引物进行序列扩增(引物见表1)。