《表1 各SLC25A13基因突变位点的PCR扩增引物及荧光/淬灭探针》
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《希特林蛋白缺乏症实时荧光PCR解链曲线快速基因分型的建立与应用》
注:F,正向引物;R,反向引物;PF,荧光标记探针(PF-W,野生型探针;PF-M,突变型探针);PQ,淬灭探针。
参照本课题组的实时荧光PCR解链曲线基因突变检测通用技术方案及技术发明专利[10-11],根据SLC25A13基因(NC_000007.14) DNA序列中c.851-854del GTAT、c.1638-1660dup23、IVS6+5G>A突变位点所在位置,分别设计相应的PCR扩增引物、荧光标记及对应淬灭探针。其中,针对2种突变类型分别采用不同的荧光标记探针设计方案:针对c.851-854del GTAT、IVS6+5G>A等In/Del或点突变类型,以突变位点野生型或突变型的互补DNA序列为探针,利用探针与野生型和突变型的杂交/解链温度差异而实现检测目标;针对c.1638-1660dup23等片段插入或缺失突变类型,则分别设计Tm值不同的野生型和突变型探针。PCR扩增引物及荧光/淬灭探针见表1,均由上海生工生物公司合成。
图表编号 | XD00204440700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.28 |
作者 | 刘海平、秦佳纯、袁伟曦、黄伟伦、周万军 |
绘制单位 | 佛山市妇幼保健院新生儿疾病筛查中心、南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室、佛山市妇幼保健院新生儿疾病筛查中心、南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室、南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室 |
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