《表3 ATCC39727中TCS功能预测Tab.3 Function prediction of TCSs in ATCC39727》

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《野野村放线菌ATCC 39727的双组份信号转导系统的生物信息学分析》

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根据ATCC39727基因组中HKs和RRs蛋白的保守结构域和相对位置，发现了60对不同的TCS。根据Blast P结果注释和相关文献，对60对TCS的功能进行了预测和分析（表3）。结果表明，ATCC39727中的TCS同其他微生物中的功能类似，主要包括细胞壁和细胞膜的合成和调节，例如VraS/VraR（调节肽聚糖合成）、LiaS/LiaR（与细胞壁压力和抗菌肽调节相关）、MtrA/MtrB（调节渗透压）、DesR/DesK（调节细胞膜流动性）；调节细胞形态分化，例如BaeS/BaeR（调节DNA起始复制）、ArlS/ArlR（调控接合和自溶）、DevR/DevS（启动细胞休眠）、DegS/DegU（调控生物膜形成）、PrrB/PrrA（调控细胞早期增殖）、YdfH/Y d f I（参与细胞分化）；参与营养元素代谢，例如NarS/NarL（参与硝酸盐代谢）、PhoP/PhoR（参与磷代谢）、NreB/NreC（参与硝酸盐异化和亚硝酸盐代谢）、NarX/NarP（调节氮代谢）；调节重金属离子平衡和抗性，例如CzcS/CzcR（调节Zn代谢）、CopS/CopR（与铜抗性基因有关）、CutS/CutR（调节铜代谢）、IrlR/IrlS（与重金属抗性有关）、PcoS/PcoR（活化铜抗性基因）、TcrY/TcrX（与铁缺乏有关）；与细胞抗性和毒力相关，例如YvfT/YvfU（与细菌毒力有关）；调节细胞呼吸和途径代谢，例如ResD/ResE（调控有氧和无氧呼吸）、MprB/MprA（全局调控子）、UhpC/UhpB（调控己糖磷酸化）。