《表2 Nonomuraea sp.ATCC39727基因组中双组份系统》

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《野野村放线菌ATCC 39727的双组份信号转导系统的生物信息学分析》


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与其他微生物相比,放线菌具有复杂的形态分化和丰富的次级代谢网络。与之相对应,放线菌也含有丰富的TCS系统,与大肠埃希菌和枯草芽孢杆菌平均25个成对TCS相比,天蓝色链霉菌和野野村放线菌则分别含有67对和60对TCS(表1)。进一步对比发现,野野村放线菌TCS系统中的HK和RR蛋白更加保守,几乎没有特异性结构域。通过搜索比对和分析发现,ATCC39727基因组中含有丰富的TCS基因,共有213个相关编码基因。进一步分析其中112个基因编码HK蛋白,包含60个TCS HK-RR和52个孤儿HK,99个基因编码TCS RR蛋白,包含60个HK-RR和39个孤儿RR,另外还有2个融合HK(表2)。尽管在细菌基因组中TCS基因所占比例不大(通常低于5%),但在调控微生物生理生化代谢中发挥重要作用。