《表1 候选内参基因引物序列和扩增子》
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选》
部分候选基因的引物来源于前人相关的研究,另外一些候选基因的引物来源与刺葡萄细胞培养物转录组的de novo序列.这些引物序列通过在线软件Primer-BLAST(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/)分析设计,由福州尚亚生物技术有限公司合成引物.采用TB GreenTM Premix Ex TaqTM II(Tli RNaseH Plus)(TaKaRa公司)试剂,基于罗氏Light Cycler?480II平台进行RT-qPCR扩增反应来验证引物的特异性.反应体系为20μL体系:TB GreenTM Premix Ex TaqTM II(Tli RNaseH Plus)(TaKaRa)10μL、上下游引物(10μmol/L)分别0.8μL、模板cDNA 2μL、无菌水6.4μL.PCR反应程序为:95℃预变性30 s;95℃变性5 s,60℃退火30 s,40个循环;融解曲线,95℃变性5 s,60℃退火1 min,梯度加热(每秒0.11℃),直至95℃,1个循环;最后快速降温(每秒2.2℃)至50℃,30 s,1个循环.每个RT-qPCR反应设3次重复,并以不添加模板的空白管为对照.通过单峰的溶解曲线来验证.利用1.5%的琼脂糖凝胶电泳来验证扩增子的单一条带.最终选取10个候选基因,进行下一步的试验,这10个基因包括Actin、AP-2、EF1-α、GAPDH、VAG、SAND、α-Tubulin、NAD5、60SRP、UBQ10.所用的引物序列及其相关的参数见表1.
图表编号 | XD00126782300 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 潘红、赖呈纯、张静、黄贤贵、林玉玲、赖钟雄 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建省农业科学院农业工程技术研究所、福建省农产品(食品)加工重点实验室、福建省农业科学院农业工程技术研究所、福建省农产品(食品)加工重点实验室、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建省农业科学院农业工程技术研究所、福建省农产品(食品)加工重点实验室、福建省农业科学院农业工程技术研究所、福建省农产品(食品)加工重点实验室、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |