《表1 Zmcnp1的氨基酸组成》

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《玉米中编码C2结构域蛋白基因Zmcnp1的克隆及表达特性分析》

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运用Prot Param分析Zmcnp1理化性质。Zmcnp1含143个氨基酸，分子量为15770.56 u，分子式为C698H1075N177O229S5，含2184个原子，等电点为4.29。总的带负电荷的氨基酸残基（Asp+Glu）为26，占该蛋白总氨基氨酸残基数的18.18%；总的带正电荷的氨基酸残基（Arg+Lys）为10，占该蛋白总氨基酸残基数的6.99%（表1）。经Prot Scale软件分析发现：Zmcnp1蛋白143个氨基酸，其中37.1%的氨基酸表现出疏水性，且第12位丝氨酸（Ser）具有最高的疏水值为1.833；61.48%的氨基酸表现出亲水性，且第130位脯氨酸（Pro）和131位天冬氨酸（Asp）同时具有最高的亲水值为-3.200 （图3A）。因此玉米Zmcnp1总体表现为亲水性。使用Net Phos 3.1 Server （Wang et al.，2009）对Zmcnp1的磷酸化位点进行预测，结果发现Zmcnp1包含15个假定的磷酸化位点，分别为7个丝氨酸（Ser）位点（第12，40，41，48，61，74和97位Ser），6个苏氨酸（Thr）位点（19，35，64，77，86和127位的Thr）和111与139位的2个酪氨酸（Tyr）位点，其中有13个假定的磷酸化位点位于C2结构域的内部（图3B）。通过Signal P 5.0在线预测，发现Zmcnp1的N-端不存在明显的信号肽特征（图3C）。根据TMHMM 2.0预测结果（图3D）显示在细胞内膜与外膜之间不存在跨膜螺旋结构，Zmcnp1为非分泌蛋白。进一步利用Y-Loc （Liu et al.，2013）软件在线预测，表明Zmcnp1最有可能为细胞质蛋白，位于细胞质的可能性高达96.8%，其次是细胞核（2.9%），分泌途径和线粒体分别占0.2%和0.1%。运用SOPMA软件预测Zmcnp1二级结构，其二级结构主要为无规则卷曲（c，54.55%），延伸链（e）占25.87%，而α螺旋（h）占13.29%，β转角（T）仅占6.29%（图2B）。