《表3 远紫外CD光谱分析Oxa中各二级结构含量》

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《重组ZEN降解酶Oxa的纯化及特性研究》


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通过CDNN软件对CD谱图进行处理,得到Oxa的二级结构组成类型,如表3所示,Oxa的二级结构主要由无规则卷曲和β-折叠组成,而α-螺旋和β-转角组成较低,这可能是由于Oxa中异亮氨酸、谷氨酸、天冬氨酸等具有大侧链R的氨基酸含量较高,因空间位阻不易形成有序的其他三种结构,而多形成无规卷曲,酶的功能部位常常处于这种构象区域。β-折叠中反平行式的组成更多,肽链更为伸展,酶结构更为稳定。同时,Oxa中酸性氨基酸含量为13.83%,其侧链R解离了相同的负电荷,因此同性相斥而不易形成稳定的α-螺旋;甘氨酸无侧链易于调整空间位阻,脯氨酸具有环状结构和固定的Φ角,均利于β-转角的形成,促进多肽链自身回折,而Oxa中脯氨酸和甘氨酸含量较低,故β-转角形成也较少。这些有序的二级结构单元,通过氢键等非共价键来维持酶空间结构的相对稳定。CD光谱测得数据与NPS预测的二级结构有一定的差异,可能是因为重组Oxa纯化后仍具有少量杂蛋白,其结构处于一种接近天然Oxa结构的状态。