《表1 红心杉转录组transcript和unigene数据组装统计》

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《基于转录组测序的陈山红心杉EST-SSR开发及应用》

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红心杉叶片转录组测序共获得99 122 394个reads片段，包含14.87 Gb序列信息，GC含量平均值为43.40%，碱基Q30为90.44%，说明测序质量非常可靠。采用Trinity拼接得到201 234个transcript片段，序列信息为146 288 475 bp(146.29 Mb），平均长度为727 bp，N50为1 270 bp。对不同长度transcript进行统计，长度为200～500 bp的transcript最多，有127 065个，占总体的63.14%（表1）。对序列进行组装，共获得76 597个unigene，序列信息为104 182 562bp(104.18 Mb），序列大小为201～17 690 bp，平均长983 bp，N50为1 963 bp，表明数据组装质量较高。其中，≥1 000 bp的unigene最多，有37 687个，占总体的49.20%；其次为500～1 000 bp的unigene，占总体的29.79%（表1）。