《表1 转录组测序数据及其组装结果》

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《藤茶高通量转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因挖掘》


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采用Trinity将所有Clean reads拼接得到153528条转录本,平均长度为841 bp,N50为1541 bp,其中,以长度200~500 bp的序列数量最多,为83963条,占54.69%;以长度>2000 bp的序列数量最少,为16368条,占10.66%。将转录本进一步组装拼接得到92472条Unigenes,平均长度为1208 bp,N50为1780 bp,其中,以长度500~1000 bp的序列数量最多,为26916条,占29.11%;以长度>2000 bp的序列数量最少,为16368条,占17.70%(表1)。