《表2 水仙鳞茎转录组测序组装和注释情况》

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《乙烯处理水仙催多花技术和机理的研究》

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将不同处理（ETH，1-MCP，CG）1 d的水仙鳞茎送到广州基迪奥生物科技有限公司进行RNA-Seq测序，将测序原始数据登录到NCBI，SRA登录号为SRP158548，表2为转录组测序组装和注释情况。在去除低质量读长（dirty reads）、接头序列和rRNA序列后，获得了20 957 860（CG）、27 640 372（1-MCP）和32 661 490（ETH）的干净读长（clean reads），通过序列拼接获得67 251个Unigene，平均序列长度为692 bp。所有基因表达数量为65 898，各样品表达基因数分别为55 793（CG）、57 321（1-MCP）和64 350（ETH）。利用Nr、KEGG、Swiss-prot和KOG数据库对unigenes进行注释，在Nr数据库注释到38 315个，在Swiss-prot数据库注释到26 804个，在KOG数据库注释到23 984个，在KEGG数据库注释到16 298个unigene。总的来说，一共注释到了38 754个unigene（表2）。16 298个unigene涉及到127个KEGG代谢途径，23 984个unigene分为25个KOG大类。对差异表达基因进行GO功能分析，所有基因归属于3个大类:生物学过程（biological process）、细胞组分（cellular component）和分子功能（molecular function）。外源乙烯处理提高了水仙鳞茎的活性，促进了GO term中大部分基因上调表达（图3）。经统计，与对照相比在乙烯处理中有12960个基因上调表达，2 255个基因下调表达；在1-MCP处理中仅有2 151个基因上调表达，2 910个基因下调表达（图4）。