《表1 核桃内果皮转录组测序组装统计》

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《纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因筛选及功能预测》

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注:Total consensus sequences为组装出的Unigene个数；Total length为所有Unigene序列的总碱基数；Mean length为Unigene平均碱基数；N50为所有Unigene依大小排列，从最小的Unigene开始累加计算碱基数，累加碱基数等于总碱基数一半时对应Unigene的碱基数即为Unigene的N50；Distinct

获得花后51、66和80 d三个时期的核桃内果皮样品，分别提取各样品中的总RNA，利用Illumina Hiseq 2000平台分别对各样品进行测序。共得到171 968 208条raw reads片段，利用filter＿fq软件对reads进行过滤后共得到159 692 320条clean reads片段，其中包含有14 372 308 800个核苷酸信息，平均Q20（准确率为99%）为98.09%，平均GC%含量45.65%，说明测序数据质量较好，可用于后续的分析（图2）。利用Trinity软件对51、66和80 d三个时期的转录组测序数据进行De novo组装，总共获得76 814条Unigene，其中51、66和80 d分别获得74630、72 810和74 561条序列，平均长度1 258个核苷酸（表1）。