《表2 新塔花转录组组装情况统计》

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《基于转录组测序挖掘新塔花黄酮类物质生物合成相关基因》

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利用Illumina Next Seq 500高通量测序平台对3个新塔花的花序进行测序。经过筛选，分别得到4.47，4.45，4.46 Gb数据。使用针对转录组拼接的Trinity（版本r20140717，k-mer 25 bp）软件中Inchworm，Chrysalis和Butterfly 3个模块按照顺序处理RNA-seq数据进行组装拼接成contig序列，将contig序列进行聚类处理，获得117 943条transcript，平均长度587 bp。N50为756 bp，长度大于N50的序列总数27 898条。N90为279 bp，长度大于N90的序列总数88 840条。获得unigene 77 366条，平均长度551bp，N50为704 bp，长度大于N50的序列总数17 964，N90为263 bp，长度大于N90的序列总数58 911条。结果见表2。