《表1 三叶青转录组数据组装质量统计》

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《三叶青块根发育比较转录组分析》


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注:Th WWG_1,Th WWG_2:纤维根样品重复1与重复2;Th WYG_1,Th WYG_2:初始膨大块根样品重复1与重复2;Th WWY_1,Th WWY_2:具有纤维根的植株的叶片重复1与重复2;Th WYY_1,Th WYY_2:初始膨大块根植株的叶片重复1与重复2

在本研究中,建立8个测序文库用于BGISEQ-500-RS平台测序。8个文库中获得的原始数据53.23GB,去除低质量、接头污染及未知碱基(N)含量过高的Reads,处理后组装得到了的131 142个Unigenes,总长度147 765 404 bp、平均长度1 126 bp、N50为1 979 bp以及GC含量为41.97%(表1)。每个样品池的Q20不低于98%,GC含量高于40%,Clean reads ratio在95%左右,表明样品池的覆盖度及饱和度较好,可以用于下一步实验分析。