《表5 象草eg7和eg87转录组数据unigene组装统计》

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《基于转录组测序分析象草木质素合成的研究》

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采用Illumina Hiseq 2000高通量测序技术对象草茎组织进行转录组测序，共得到了169630902条原始片段，过滤去除低质量片断和接头后获得153204888条、共13788439920nt的clean read，其Q20%为97.25%～98.48%（表3）。原始测序数据已提交到NCBI的序列片段归档（sequence read archive，SRA）数据库（BioprojectID:PRJNA357342）。经Trinity程序（http://trinityrnaseq.sourceforge.net/）对象草转录组clean read进行无参拼接后，共获得317216个contigs（eg7:148201；eg87:169015），其中≥500nt的contig序列有37155个（eg7:17259；eg87:19896）（表4） ，在contig数据基础上，进一步对序列进行组装，共获得87641个unigene序列，平均长度为580nt，N50为780nt，其中12863unigene（14.68%）序列长度大于1000nt（表5）。