《表2 不同数据库中江鳕转录组unigenes注释统计》

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《基于RNA-seq技术的江鳕不同组织转录组比较分析》

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≥300 nt：注释到该数据库的长度大于300个碱基的unigenes数；≥1000 nt：注释到该数据库的长度大于1000个碱基的Unigenes数；COG：蛋白相邻类的聚簇数据库；GO：基因本体数据库；KEGG：京都基因与基因组百科全书；KOG：真核生物蛋白质同源簇数据库；Pfam：蛋白质家族的集合数据

通过BLAST 2.0和HMMER 3.1软件与相应数据库比对，最终获得有注释信息的unigenes数量为32 745个，约占总unigenes数量的30.87%（表2），比对到NR数据库的unigenes数量最多，为32 122条，COG注释的信息最少，仅为7 203条。unigenes在7个不同数据库中的同源比对数目占总unigenes的百分比分别为6.79%（COG）、10.23%（GO）、13.04%（KEGG）、20.42%（KOG）、21.05%（Pfam）、17.47%（Swiss-Prot）、30.28%（NR）。这些获得注释的基因为进一步研究基因功能提供了参考。