《表1 转录组基因在各数据库中注释率统计》

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《多形微眼藻在不同氮源条件下固碳途径的转录组解析及与其他微藻的比对》


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对照组和实验组经无参基因组分析,共得到58354条序列。删除低质量测序序列后,共得到43341条非重复序列基因。这些序列在GO、PFAM、Nr数据库中有较高比对率,分别为67.73%、67.02%、65.85%,而在Nt、KO、Swiss Port、KOG数据库中比对率较低,均值约30%(表1)。在至少一个数据库中有注释的序列占83.31%,而同时在所有数据库中均有注释的序列只有7.35%。