《表3 金钱松转录组基因注释成功率统计》

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《中国濒危植物金钱松转录组测序及生物信息学分析》

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All databases：在以上7个数据库中都注释成功的Unigene数目及占总Unigene的比例，At least one database：在以上7个数据库中至少一个数据库注释成功的Unigene数目及占总Unigene的比例

利用生物信息学方法对金钱松转录组数据进行7大数据库的比对注释、基因功能及代谢通路分析，结果显示有43 674条（61.72%）金钱松Unigene注释成功。其中Nr (e-value≤1e-5）注释成功的Unigene数目有35 467条，占组装得到总Unigene的50.12%；Nt (e-value≤1e-5）有24 161条，占34.14%；KEGG (e-val‐ue≤1e-10）有14 623条，占20.66%；SwissProt (e-value≤1e-5）有29 744条，占总Unigene的42.03%；KOG (e-value≤1e-3）有15 931条，占22.51%；GO (e-value≤1e-3）有28 355条，占40.07%；Pfam (e-value≤0.01）有27 804条，占39.29%。通过blast软件与这7大数据库序列比对发现有6 450条Unigene在以上数据库中都能注释成功，占总Unigene的9.11%（表3）。