《表4 金钱松Unigene的KOG功能分类》

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《中国濒危植物金钱松转录组测序及生物信息学分析》

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将组装得到的Unigene输入KOG数据库进行同源基因匹配，共用15 931条Unige‐ne获得了注释，占组装得到总Unigene的22.51%。根据匹配结果共分为26个可能的功能大类，包括了细胞结构、生化代谢、分子加工、信号转导等蛋白家族部分。其中用于一般功能预测的聚类（2 705，15.25%）代表了最大的组，其次是翻译后修饰、蛋白质转运和分子伴侣（1 359，13.39%），翻译、核糖体结构和生物发生（1 482，8.35%），能源生产和转换（1 122，6.33%），信号转导机制（1 137，6.41%），细胞内转运、分泌和囊泡运输（916，5.16%）。而只有少数Unigene被分配到细胞核结构和胞外结构（分别为67和47条Unigene）以及未命名蛋白和细胞运动（分别为6个和1个Unigene）。细胞壁/膜及防御机制匹配比例也较低（低于1%）。此外，870个Unigene被分配到碳水化合物的运输和代谢，占4.9%。838个Unigene被分配到脂质运输和代谢，占4.72%，809个Unigene被分配到次生代谢产物生物合成、转运和分解代谢，占4.56%（表4) ，754个Unigene被分配到RNA加工和修饰，占4.25%（表4）。由以上数据可以看出，金钱松转录、翻译、修饰及蛋白运输参与的基因最多，代谢次之，细胞壁/膜及防御机制最少。