《表4 泡桐根部Unigene序列在各数据库的功能注释情况》

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《泡桐根系应答铅锌矿胁迫的转录组分析》


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将获得的基因序列在常用数据库(Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-Prot,KEGG,GO)中进行序列对比,最终获得96 133条有注释信息的基因序列,注释率为76.25%(表4)。经Nr数据库比对后发现,泡桐根部基因序列与芝麻Sesamum indicum基因序列同源性最高,达到20.9%,其后依次为栓皮栎Quercus variabilis(12.5%),紫花风铃Handroanthus impetiginosus(10.6%)和蓖麻Ricinus communis(5.3%),与其他物种同源的有32 416条(50.7%)。注释后相似度达60%~80%、80%~95%、95%~100%的基因分别有23 337条(36.5%)、18 222条(28.5%)、4 795条(7.5%)。