《表4 泡桐根部Unigene序列在各数据库的功能注释情况》
将获得的基因序列在常用数据库(Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-Prot,KEGG,GO)中进行序列对比,最终获得96 133条有注释信息的基因序列,注释率为76.25%(表4)。经Nr数据库比对后发现,泡桐根部基因序列与芝麻Sesamum indicum基因序列同源性最高,达到20.9%,其后依次为栓皮栎Quercus variabilis(12.5%),紫花风铃Handroanthus impetiginosus(10.6%)和蓖麻Ricinus communis(5.3%),与其他物种同源的有32 416条(50.7%)。注释后相似度达60%~80%、80%~95%、95%~100%的基因分别有23 337条(36.5%)、18 222条(28.5%)、4 795条(7.5%)。
图表编号 | XD00160690000 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.08.01 |
作者 | 韩良泽、陈明利、陈永华、陈昊、贾惠雁、欧阳林男 |
绘制单位 | 中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学林学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、国家林业和草原局桉树研究开发中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |