《表1 Unigene功能注释统计》
在NCBI中使用BLAST软件对Unigene序列进行功能注释,包括与NR非冗余蛋白质数据库、Swiss-Prot蛋白质数据库、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、COG (Clusters of Orthologous Groups)、KOG (euKaryotic Ortholog Groups)、GO (Gene Ontology)和Pfam (Protein family)蛋白质数据库的比对,本项目以BLAST参数E-value≤1e-5和HMMER参数E-value≤1e-10为选择标准,最终有26 488个Unigene的功能得到注释。其中在NR蛋白数据库中注释的Unigene数量最多,为25 054个,其次是eggNOG,为23 509个。在GO和KEGG数据库中分别注释了14 850和10 098个Unigene (表1)。
图表编号 | XD00194382900 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 符真珠、徐梦岚、袁欣、王慧娟、李艳敏、张和臣 |
绘制单位 | 河南省农业科学院园艺研究所、河南省农业科学院园艺研究所、河南农业大学林学院、河南省农业科学院园艺研究所、河南省农业科学院园艺研究所、河南省农业科学院园艺研究所、河南省农业科学院园艺研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |