《表1 黄唇鱼Unigene的功能注释结果》

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《基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选》

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Overall：被七大数据库中任意一个数据库注释上的Unigene总数

采用BLAST对组装获得的Unigenes进行七大功能数据库（NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro）注释，注释结果详见表1。其中，38086条Unigenes注释到NR数据库（58.55%），54929条Unigenes注释到NT数据库（84.45%），32384条Unigenes注释到Swissprot数据库（49.79%），12572条Unigenes注释到COG数据库（19.33%），31228条Unigenes注释到KEGG数据库（48.01%），3099条Unigenes注释到GO数据库（4.76%），28318条Unigenes注释到Interpro数据库（43.53%）。NR数据库属于非冗余蛋白序列数据库，其数据来源于GenPept、Swissprot、PIR、PDF、PDB和NCBI RefSeq。根据NR注释结果统计注释基因的物种分布情况，结果（图2）显示，80.68%黄唇鱼Unigenes能匹配到大黄鱼（Larimichthys crocea）的相应蛋白中，表明在所比对的鱼类中，黄唇鱼与大黄鱼的同源性最高，二者亲缘关系最近；其次为深裂眶锯雀鲷（Stegastes partitus）（2.98%）、虹鳟（Oncorhynchus mykiss）（1.21%）和尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）（1.18%）；匹配到其他物种上的Unigege比例为13.95%。