《表2 Unigene功能注释结果》

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《基于转录组分析筛选牛心朴子响应低温胁迫的转录因子家族》

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从CK组和CT组共获得30.50 Gb的原始数据，Cycle Q20平均值在96%以上，表明测序数据质量较好，可用于后续分析。经数据过滤及去冗余后，对高质量Clean reads进行拼接组装后获得转录本序列，取每个基因最长的转录本作为Unigene，最终获得100006条Unigenes，平均长度为649 bp，N50为1129bp。由表2可知，100006条Unigenes在NR、GO、PFAM、SwissProt、NT、KOG、KO等数据库中注释的Unigenes分别为34682（占34.67%）、33935（占33.93%）、333363（占33.36%）、30771（占30.76%）、21017（占21.01%）、20214（占20.21%）和17695条（占17.69%）。有47082条Unigenes至少在一个数据库中得到功能注释，占Unigenes总数的47.07%；而在以上7个数据库均被注释的Unigenes仅有7070条，仅占Unigenes总数的7.06%。可见，牛心朴子Unigenes功能注释率较低。