《表2 Unigene的功能注释》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《溪黄草转录组测序及生物信息学分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

将溪黄草组装后的unigene序列与CDD、KOG、COG、NR、NT、PFAM、Swissprot、TrEMBL等多个数据库进行比对，共有23 978条（64.08%)unigene在至少一个数据库中获得功能注释，2 429条（6.49%)unigene在所有数据库种均能获得注释，见表2。其中NR数据库中注释到的unigene数目（23 623条）最多，占总unigene的63.13%，其次为TrEMBL数据库，注释到的unigene为23 393条，占62.52%。KEGG数据库中注释到的unigene数目（3 674条，9.82%）最少。尚有13 440条unigene没有得到有效注释，占35.92%。见表2。通过与NR库的比对，获得溪黄草unigene序列与近缘种属的近似情况并获得同源序列的功能信息，共有23 616条unigene获得注释。匹配较多的物种主要有Sesamum indicum、Erythranthe guttata、Dorcoceras hygrometricum和Salvia miltiorrhiza，分别占58.88%、20.39%、3.16%和1.97%，见图2。表明溪黄草与唇形目（管状花目）Sesamum indicum的序列相似度最高。