《表6 象草unigene在6个数据库中的功能注释情况》

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《基于转录组测序分析象草木质素合成的研究》


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为了预测象草unigene的功能,对unigene进行蛋白编码序列(coding sequences,CDS)预测,比对到蛋白库的CDS有56725个,理论的CDS有3532个,预测到CDS的unigene共60257个(68.75%)。将unigene核酸序列及预测的蛋白序列分别与NCBI Nr、NCBI Nt、Swiss-Prot、GO、COG和KEGG数据库进行比对,通过序列相似性对unigene进行功能注释,最终87641条unigenes中有62557条(71.38%)获得注释,其中Nr和Nt数据库注释的信息最多,分别是64.35%和63.33%。统计结果见表6。