《表8 象草中差异表达的ClassⅢ型植物过氧化物酶基因》

《表8 象草中差异表达的ClassⅢ型植物过氧化物酶基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于转录组测序分析象草木质素合成的研究》


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在285条苯丙烷类代谢差异基因中,101条unigenes注释为ClassⅢ型植物过氧化物酶[peroxidase(EC:1.11.1.7),CIII Prxs],占整个苯丙烷类代谢通路差异基因的35.4%,其中表达上调的有22条,占该通路中上调表达差异基因的16.5%,其中RPKM比值上调2、4、8、16、32、64倍以上基因数目分别为7、7、2、2、2和2个;表达下调的有79条,占下调表达差异基因的52.3%,其中RPKM比值下调2,4,8、16、32、64倍以上基因数目分别为24、13、9、9、3和21个,且其中20条在eg7中表达量极低(raw reads为0)。我们筛选出通路中unigene长度≥1000nt、表达差异大于2倍的CIII Prxs基因(表8),其中下调基因14条,有6个基因表达下调8倍以上,上调基因3条,上调2~4倍;这些基因可能在苯丙烷类和木质素代谢过程中发挥重要作用,我们选择其中差异最为显著的CL843.Contig2、CL438.Contig3、CL438.Contig4、Unigene22891、CL438.Contig5、CL11176.Contig2和CL467.Contig1作为CIII Prxs候选基因待进一步分析。