《表5 植物激素转导途径中的差异基因及其表达情况》

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《亚洲棉短绒突变体纤维发育及其差异基因表达分析》

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通过对2个材料4个纤维发育时期的差异基因KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路富集分析（图4-C）发现，40个基因参与到植物-病原菌互作过程；20个基因参与到精氨酸和脯氨酸代谢过程；52个基因参与到内质网上蛋白加工过程；30个基因涉及到苯丙烷代谢过程；17个基因涉及到角质、木质素和蜡质生物合成过程；44个基因参与到苯丙烷生物合成过程；92个基因汇集到植物激素信号传导过程。对KEGG途径富集因子较高的植物激素信号传导途径中的苯丙烷生物合成途径和角质木质素以及蜡质生物合成途径的差异基因进一步分析发现（表4和表5），26个差异基因与生长素响应以及生物合成有关，与野生型（fz）相比，突变体（FZ）大部分基因在+5DPA时上调，在+8DPA时下调，在+3DPA时基因表达差异不明显，表明生长素（IAA）对短绒的起始没有影响，对短绒纤维的伸长起正调控作用；12个基因参与脱落酸（ABA）和乙烯信号转导过程，如乙烯响应因子和脱落酸受体，这些基因在短绒纤维起始时期+5DPA突变体中显著上调，Ga11G2673基因差异倍数达到15以上，而这些基因在纤维伸长时期+8DPA突变体中下调，这些结果说明棉花体内过量的ABA和乙烯抑制纤维的发育，而少量的乙烯能促进纤维伸长。参与角质、软木质、蜡质生物合成途径的基因有8个，主要是细胞色素氧化酶P450和脂肪酸羟化酶（表4）；参与苯丙烷代谢和生物合成途径有关的基因有23个，大部分为过氧化物酶以及2个苯丙氨酸裂合酶、3个甲基转移酶和1个花青素葡萄糖基转移酶，说明这些基因与短绒纤维的起始和发育有关。