《表1 金钱松测序产出数据质量评估》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《中国濒危植物金钱松转录组测序及生物信息学分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

Q20、Q30:Phred数值大于20、30的碱基占总体碱基的百分比；GC content：碱基G和C的数量总和占总的碱基数量的百分比

从金钱松cDNA文库高通量测序中共获得了49 521 192个原始读数，去除带有接头的、低质量的以及N的比例大于10%的reads，得到了47 477 676条clean reads，总长7.12 Gb，Q30（碱基正确识别率达99.9%）高质量序列占91.29%，Q20（碱基正确识别率达99%）序列占96.59%，GC含量占总碱基46.32%，碱基错误率为0.02%，低于1%（表1）。说明通过Illumina HiSeqTM2500平台测序得到的金钱松数据质量比较高，满足后续生物信息学分析。