《表2 数字表达谱测序数据质量评估》

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《旱垂柳转录组测序及赤霉素在垂枝形成中的作用》

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将数字表达谱中经过过滤的高质量序列Clean reads往转录组的参考序列做mapping，对比后匹配度均大于76%（表2）。然后将旱垂柳的相同组织样品在4个发育时期之间，以及不同组织（叶片，茎尖和茎基部）在相同发育时期之间的数字表达谱结果进行两两对比分析，最终确认8 359个差异表达的基因，可以说明旱垂柳3个组织在4个发育时期存在着很大的变化。为了更好地了解激素在柳树垂枝形成中的作用，将激素相关的基因进行了筛选，并对赤霉素进行后续分析。这些激素相关的基因主要是生长素，细胞分裂素，独角金内酯，脱落酸，赤霉素，乙烯，油菜素内酯，茉莉酸，多胺和水杨酸。最终确定427个在旱垂柳的不同组织和不同发育时期差异表达的基因，且绝大部分与乙烯（30.4%），生长素（27.9%）和赤霉素（7.5%）有关。