《表4 数据集总结：蛋白质组串联谱图De novo测序软件的比较与评估》

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《蛋白质组串联谱图De novo测序软件的比较与评估》

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为了保证评估结果的普适性和有效性，选取了CID和HCD两种谱图下多个物种的数据集作为评估测试的数据集。CID谱图集中的数据均来自LTQ Orbitrap仪器中的CID碎裂技术；HCD谱图集中的数据来自Thermo Scientific Q-Exactive仪器中的HCD碎裂技术。所有数据集均可从Proteome Xchange数据库中下载得到（表4）。对所有下载的到的Raw文件，均使用Proteowizard ms Covert （v3.0.9134）（Chambers et al.，2012）转化为mgf格式。HCD谱图在转化过程中使用peak picking来挑选峰值。