《表2 转录组测序数据质量评估》

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《苗期水稻响应褐飞虱取食的基因差异表达分析》


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CK1、CK2、CK3为对照组水稻样品;BFR1、BFR2、BFR3为褐飞虱取食6 h后水稻样品。

6个样品转录组测序得到的原始数据经过滤,分别得到60 034 869、58 905 381、57 745 824、53 269 890、56 389 786和63 845 983条读长,其Q30碱基比率分别为96.15%、96.06%、96.05%、96.31%、95.94%和96.02%,均大于95%,低质量读长比率均在1%以下。将6个样品过滤得到的高质量测序数据和水稻参考基因比对,比对率分别为93.6%、92.8%、93.4%、93.4%、92.4%和92.1%,比对率均在90%以上(表2)。上述结果表明6个样品的转录组测序数据质量高,可靠性好,和水稻参考基因组匹配程度高,可以用于进一步的转录组分析。