《表3 软件测序速度比较：蛋白质组串联谱图De novo测序软件的比较与评估》

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《蛋白质组串联谱图De novo测序软件的比较与评估》

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在CID和HCD两个数据集中，p Novo3的测序速度均为最高，Novor居其次，Pep Novo+的速度最慢，平均每秒仅解析1.9张谱图。研究者可以根据自己的实验条件选择合适的计算方案，进一步提高测序效率（表3）。