《表2 测序数据质量评估:基于RNA-Seq转录组测序技术揭示肉兔生长发育调控的分子机制》

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《基于RNA-Seq转录组测序技术揭示肉兔生长发育调控的分子机制》


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将测序数据经过质量控制后得到的Clean reads进行碱基含量、碱基质量分布统计,碱基有效比率Valid bases在89.9%以上,Q30在90%以上(表2);测序数据与家兔的参考基因组的比对效率都在91%以上(表3)。此外,绝大多数Reads都比对到了CDS_Exon区域(图2),综合表明测序数据好,且可利用率高。由可变剪接分析结果(图3),共发现12种类型可变剪切,其中最主要类型为:可变第1外显子(alternative first exons,TSS)、可变末尾外显子(alternative last exons,TTS)和单外显子跳跃(skipped exons,SKIP)。