《表1 小麦条锈菌转录组测序数据评估统计》

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《小麦条锈菌产孢转录组分析》

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分析原始读长碱基的测序错误率和Q值分布，可以检测测序数据的质量。测序错误率受多因素影响，转录组的测序错误率具有2个特点：一是随着测序读长长度增加测序错误率升高；二是读长端的前6个碱基位置测序错误率较高。前者是由于测序过程中化学试剂消耗而导致的，后者是因为随机引物和RNA模板不完全结合，而这6个碱基位置恰好是文库构建时反转录中随机引物的位置。一般样品的读长中每个碱基测序错误率应该低于0.5%。CY31、CY32、CY33和V26菌系测序过程碱基错误率均低于0.02%（表1）。除了碱基的测序错误率外，碱基的质量也是RNA-Seq测序质量评估的一个重要指标，一般Q30在80%以上的测序质量非常可靠。本研究4个样品的Q20均在95.63%以上，Q30在89.79%以上（表1）。表明转录组测序得到的质量结果可靠，可用于后续分析。