《表2 转录组测序数据质控统计》

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《牛副流感病毒3型感染MDBK细胞后影响天然免疫基因表达的筛选与验证》

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12h对照组与感染组分别进行2个生物学重复。转录组测序得到的原始数据称为Raw Reads，随后对Raw Reads进行质控，获得的数据称为Clean Reads，以确定测序数据是否适用于后续分析。12h对照组样品获得的Clean Reads分别为23.77 M和23.68 M，12h感染组获得的Clean Reads分别为23.98 M和24.00 M，过滤率均在98.5%以上；质控后，经过滤得到的Clean Reads比对到牛基因组参考序列[Bos taurus（assembly ARS-UCD1.2）]，对照组分别获得88.87%和91.09%的基因定位率，感染组分别获得88.48%和87.67%的基因定位率（表2）。