《表1 西瓜果肉样本转录组测序数据统计》

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《基于转录组测序的西瓜果肉硬度相关基因表达分析》

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通过Illumina平台对‘京欣3号’西瓜、‘甜王’西瓜果肉样本测序（表1），使用Seq Prep和Sickle软件对原始测序数据进行质控，使用Top Hat2和HISAT2软件将质控后的clean reads与参考基因组比对，获得用于后续转录本组装、表达量计算等的mapped reads，对转录组测序的比对结果进行质量评估。表1显示，6个样品共获得330 387 592个原始数据，通过过滤和质量控制的原始数据共产出327 389 480个的clean reads，并且配对错误率均小于0.025 3%，Q30碱基比例在93.87%以上，与参考基因组的比对率在74.00%以上，比对效率较高。因此，6个西瓜样本转录组测序数据质量较好，可以用于后续生物学分析。