《表1 转录组测序数据质量分析》
‘绿乒乓’和‘粉乒乓’经转录组测序后,获得原始数据(Raw reads)、经数据过滤后获得的纯净序列(Clean reads)、高质量纯净碱基数(Clean bases)、GC含量以及碱基质量大于Q20、Q30的比例(表1)。2个品种的Clean data均为5 Gb以上,GC含量分别为43.00%和42.91%。碱基质量大于Q20的比例分别为98.51%和98.35%,碱基质量大于Q30的比例分别为94.86%和94.41%。2个乒乓菊品种碱基质量大于Q20和Q30的比例分别为98%和94%,表明2个乒乓菊品种的不同组织测序数据可用于后续分析。
图表编号 | XD00146689700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 周琳、蔡友铭、张永春、杨柳燕、姚建军、薛建平、叶燕萍、席祖路、于忠正 |
绘制单位 | 上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室、上海虹华园艺有限公司、上海虹华园艺有限公司、上海虹华园艺有限公司、上海虹华园艺有限公司、上海虹华园艺有限公司 |
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