《表5 NSCs转录组测序数据评价分析》

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《小鼠侧脑室下区基因表达的增龄性变化研究》


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RNA-Seq是较为成熟的一种使用深度测序技术的转录组分析方法。与其他方法相比,RNA-Seq可以更精确快速的获取待测样品大量的转录本信息,为研究基因表达提供了更加方便快捷的途径[18]。本研究通过Illumina测序平台分析检测小鼠幼年期、成年期和老年期SVZ的cDNA文库,获得小鼠SVZ在不同时期基因表达的增龄化改变。结果表明(表5),选择的实验材料测序质量好,Q20比例均在97%以上,Q30比例均在93%以上;在小鼠幼年、成年和老年期SVZ分别检测到55983268、73094774和53309824个有效的reads,对比效率为95.37%、95.62%和95.04%,显示比对效率较好,测序质量高(表6)。