《表1 测序数据控制:杂交石斑鱼和母本褐点石斑鱼转录组测序及差异表达基因分析》
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《杂交石斑鱼和母本褐点石斑鱼转录组测序及差异表达基因分析》
注:Q20指质量值大于或等于20的碱基所占的百分比;Q30指质量值大于或等于30的碱基所占的百分比;GC含量为测序数据中G和C两种碱基所占总碱基的百分比
F1和褐点石斑鱼各组织的测序数据质量控制如表1所示。用于转录组测序的RNA数量和质量检测,各组织的RIN值均符合标准,说明RNA的完整性较好,满足建库测序的要求。通过过滤分别得到7 581 722 449,6 330 804 586,8 175 941 387,6 343 265 141,6 229 084 451,7 197 785 696 bp的clean reads。这些干净读长的Q20和Q30分别在96%和89.88%以上,GC含量在40%~60%之间,说明石斑鱼转录组测序的质量较好。
图表编号 | XD0056670300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.01 |
作者 | 林明德、陈刚、马骞、王忠良、张健东、谢瑞涛、汤保贵、黄建盛、周晖、施钢、潘传豪、ERIC Amenyogbe、邓文鑫 |
绘制单位 | 广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东海洋大学水产学院、广东粤海饲料集团公司 |
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