《表1 转录组测序:苹果矮化砧木‘T337’和‘JM7’抗白粉病基因的筛选及分析》
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《苹果矮化砧木‘T337’和‘JM7’抗白粉病基因的筛选及分析》
注:R1:‘T337’正常;R2:‘JM7’正常;I1:‘T337’感病;I2:‘JM7’感病;1:未比对上参考基因组序列数比对率;2:唯一比对上的序列数比对率
为筛选与白粉病相关的基因,将正常和感病的4组样品(每组样品3个生物学重复)进行转录组测序,结果表明,Clean reads数目为24 Gb,其中测序质量Q20值均大于97%,4个样品中平均GC含量为47.69%,表明测序质量较好,满足建库等要求。将Clean reads比对到苹果参考基因组,约有57.53%的序列可被注释(表1)。
图表编号 | XD00220556400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.14 |
作者 | 慈晓彤、沈兵琪、王大玮、王玉昌、何承忠、蔡年辉、段安安 |
绘制单位 | 西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室、西南林业大学西南山地森林资 |
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