《表1 西南鸢尾转录组测序数据中筛选到的6个候选内参基因》

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《西南鸢尾花色变异实时定量PCR内参基因的筛选与验证》

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注:蓝1、蓝2、蓝3为西南鸢尾花蕾组织的3个不同生物学重复；白1、白2、白3分别为白花西南鸢尾花蕾组织的3个不同生物学重复。下同。*表示内参基因NCBI或GenBank登录号。

根据前期已完成的西南鸢尾和白花西南等尾花蕾组织的转录组测序结果数据（未发表），以估算基因表达量FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）值较高（转录组测序结果以FPKM值大于60作为目标基因表达明显的指标，本研究候选内参基因筛选标准为大于600）且在6个样品间基本一致作为筛选标准，共筛选到6个常用的内参基因（表1），同时以台湾百合（Lilium formosanum Wallace）18S基因（GenBank:D29775.1）作为来源于转录组测序数据内参基因的对照内参基因。此外，根据转录组测序KEGG数据，选取类黄酮/花青素合成途径和类胡萝卜素合成途径中的12个色素合成相关基因（其中有3个基因在西南鸢尾和白花西南鸢尾中差异表达）（表2） ，对最终筛选到的内参基因进行验证。根据候选基因核苷酸序列采用Roche LCPDS2软件设计RT-qPCR引物（表3），由北京擎科新业生物技术有限公司合成。