《表3 BSR测序数据的筛选步骤及候选基因数统计》

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《玉米矮杆突变体的筛选与候选基因鉴定》

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注：BSR高通量测序得到的数据进行逐步筛选处理：Step 1：发生突变的基因个数；Step 2：符合EMS碱基突变规律的基因个数；Step 3：突变位点SNP-index大于0.8的基因个数；Step 4：突变型突变碱基深度总和大于20的基因个数；Step 5：碱基突变造成氨基酸极性发生改变的基因个数；St

由于密码子的简并性，有些碱基突变不一定会引起氨基酸的变化或者只是同性氨基酸的变化，这些突变一般不会影响基因的功能，因此，从筛选出的序列中进一步挑选出氨基酸性质发生显著变化或终止突变的基因。5835材料中筛选出38个基因，其中2个基因的氨基酸突变为终止密码子，3个基因酸性氨基酸突变为碱性氨基酸；5858材料筛选出28个基因，其中1个基因酸性氨基酸突变为碱性氨基酸，1个基因的氨基酸突变为终止密码子；5859材料筛选出96个基因，其中氨基酸发生终止突变的有5个基因，2个基因酸性氨基酸突变为碱性氨基酸；5860材料筛选出73个基因，其中5个基因的氨基酸突变为终止密码子，2个基因酸性氨基酸突变为碱性氨基酸；58109材料筛选出38个基因，其中4个基因的氨基酸突变为终止密码子，4个基因酸性氨基酸突变为碱性氨基酸（表3）。