《表2 测序数据评估及与参考基因组比对统计》
注:Sample_ID:为项目样品统一编号;Base Sum:过滤后的碱基数;GC(%):样品GC含量,即G和C类型的碱基占总碱基的百分比;Q20(%):质量值大于等于20的碱基占总碱基数的百分比;Q30(%):质量值大于等于30的碱基占总碱基数的百分比;Clean_reads:过滤后的Clean reads数;Mapped(%):比对到
根据测得的含油量数据,在F2群体中选取30个高油单株和30个低油单株分别构建高油和低油混池,并结合两个亲本进行BSA重测序分析。30个高油单株的含油量范围57.23%~61.44%,平均值为58.37%,30个低油单株的含油量范围47.04%~51.03%,平均值为49.83%。通过Illumina Hi Seq平台对亲本及两个混池进行全基因组重测序,农大D666、P12、低油混池、高油混池测序数据量分别为81.87、82.90、89.69、90.25 Gb,过滤后得到的Clean Reads数分别为342 714 021、341 342 887、375 501 075、378 106 976,P12和农大D666的平均覆盖深度为18×,两混池的平均覆盖深度为8×。4个样本测序数据Q30为88.74%~90.24%,GC含量36.42%~37.74%,与参考基因组的比对率均为100%(表2)。
图表编号 | XD00183387000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.30 |
作者 | 李玉颖、于海洋、吕玉英、杨会、张秀荣、张昆、刘风珍、万勇善 |
绘制单位 | 山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点实验室、山东农业大学农学院、作物生物学国家重点实验室、山东省作物生物学重点 |
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