《表2 比对参考基因组结果统计》

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《红橘响应褐斑病菌侵染的转录组学分析》

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测序reads经过数据质控后，将各样品过滤后的clean reads与甜橙基因组进行比对分析，各样品的比对率及唯一比对率都相对比较均匀，详细的比对结果见表2。经测序得到的6个转录组文库中的数据与甜橙参考基因组进行比对后获得的mapped reads占总reads的74%以上，根据样品间分析可知，对照样品中的mapping率接近90%，说明在接菌后随着菌体在叶片内增殖，病原菌的转录本影响总的mapping。